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DAP-seq技術在ERF114調控蘋果根系抵御腐皮鐮刀菌研究中的應用

更新時間:2023-02-16   點擊次數:1293次

腐皮鐮刀菌是蘋果重茬連作障礙(ADR)的主要致病菌,嚴重損害蘋果根系,抑制蘋果植株正常生長。然而,蘋果抵御腐皮鐮刀菌的分子機制尚不清楚。因此,本研究對蘋果和腐皮鐮刀菌之間的相互作用機制進行了探究。

2023年1月31日,西北農林科技大學園藝學院蘋果重點實驗室的最新研究成果,發表在Plant Physiology期刊上(影響因子8.005),文章題目為“MdERF114 enhances the resistance of apple roots to Fusarium solani by regulating the transcription of MdPRX63"。該研究使用DNA親和純化測序(DAP-seq)技術鑒定了蘋果MdERF114的結合基序和靶基因。進一步研究揭示了MdERF114正向調控蘋果根系抵御腐皮鐮刀菌侵染的分子機制,為培育抗ADR的砧木提供了寶貴的基因資源。

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MdERF114在蘋果根系中受腐皮鐮刀菌誘導表達水平升高,MdERF114定位于細胞核中。過表達MdERF114提高了蘋果根系對腐皮鐮刀菌的耐受性;而干擾MdERF114的表達,根系對腐皮鐮刀菌敏感。

通過DAP-seq技術鑒定了MdERF114結合的順式作用元件GCC-box (GCCGCC),并篩選到一個與木質素合成相關的靶基因MdPRX63。隨后,酵母單雜交(Y1H)、電泳遷移率實驗(EMSA)、雙熒光素酶實驗和β-葡萄糖醛酸酶(GUS)染色實驗進一步驗證了MdERF114可以直接與MdPRX63啟動子區域的GCC-box結合。

圖1. MdERF114直接與MdPRX63啟動子結合

A. DAP-seq鑒定了MdERF114的結合元件GCC-box。B. MdPRX63啟動子序列分析顯示了GCC-box結合元件的存在。C. Y1H實驗表明MdERF114可以與MdPRX63啟動子結合。D. EMSA實驗表明MdERF114與MdPRX63啟動子中的GCC-box結合。E. 在本氏煙草中共表達MdERF114proMdPRX63影響LUC/REN的相對活性。F. GUS染色結果表明MdERF114可以激活proMdPRX63的表達。

MdERF114通過與MdPRX63啟動子結合調控其轉錄,促進蘋果根系中木質素的沉積,從而提高對腐皮鐮刀菌的抗性。MdWRKY75同樣受腐皮鐮刀菌誘導表達上調,MdWRKY75MdERF114啟動子區域的W-box元件結合調控MdERF114的表達,從而獲得對腐皮鐮刀菌的抗性。此外,MdMYB8通過與MdERF114相互作用,促進MdERF114與MdPRX63啟動子的結合,參與MdERF114介導的對腐皮鐮刀菌的防御網絡。

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圖2. MdWRKY75-MdERF114-MdMYB8-MdPRX63模塊在蘋果抵御腐皮鐮刀菌侵染中的作用

腐皮鐮刀菌誘導了MdWRKY75的表達,MdWRKY75可直接與MdERF114啟動子中的W-box基序結合。MdERF114直接與MdPRX63啟動子的GCC-box基序結合,并激活其表達,導致木質素沉積。MdMYB8的表達也由腐皮鐮刀菌誘導。MdMYB8和MdERF114之間的相互作用增強了MdERF114與MdPRX63啟動子的結合。木質素的沉積增強了蘋果根系對腐皮鐮刀菌的抗性。

小結:該研究為蘋果根系抵御腐皮鐮刀菌侵染的調控機制提供了新的見解。同時,也為利用農桿菌介導的根系轉基因技術,培育抗性砧木和防治蘋果重茬連作障礙提供了新的策略。

藍景科信提供了DAP-seq技術支持。